Impact of the national shortage of polymyxin B in critically ill patients during the COVID-19 pandemic / Impacto da escassez nacional de polimixina B em pacientes gravemente enfermos durante a pandemia de COVID-19 / Impacto del desabasto nacional de polimixina B en pacientes críticos durante la pandemia de COVID-19

Background and Objectives: during the COVID-19 pandemic, the number of critical patients requiring intensive care increased considerably, resulting in an increase in infections due to multi-resistant microorganisms. In Brazil, in 2021, due to the high demand for polymyxin B use, there was a national shortage of the medication. One strategy used to overcome this situation was aminoglycoside use. The work aimed to analyze the impact of replacing polymyxin B with amikacin and gentamicin in the final stage of patients. Method: an analytical study with an observational, cross-sectional design, with a quantitative approach, through a retrospective analysis through the analysis of medical records, with the primary stages being discharges or deaths. Results: mortality was similar between the group treated with aminoglycoside and the group treated with polymyxin B. Within the aminoglycoside group, mortality was higher in the group that had bacteria resistant to the drug than in the group that had infection with an organism sensitive to this drug. Mortality was not affected by comorbidities, age, or number of hospital infections. The main factor that led to the need for dialysis was the combination of two nephrotoxic medications. Conclusion: two hypotheses emerged: the first would be that replacing polymyxin B with aminoglycosides did not impact mortality; the other would be that, regardless of the antibiotic group used, patients had a high risk of death. Despite sample limitations, the study corroborates the adoption of strategies for the rational use of antimicrobials.(AU)

Justificativa e Objetivos: durante a pandemia de COVID-19, o número de pacientes críticos que necessitaram de cuidados intensivos aumentou consideravelmente, resultando em aumento de infecções por microrganismos multirresistentes. No Brasil, em 2021, devido à grande demanda pelo uso da polimixina B, houve escassez nacional do medicamento. Uma estratégia utilizada para superar essa situação foi o uso de aminoglicosídeos. O trabalho teve como objetivo analisar o impacto da substituição da polimixina B por amicacina e gentamicina na fase final dos pacientes. Método: estudo analítico com desenho observacional, transversal, com abordagem quantitativa, por meio de análise retrospectiva por meio de análise de prontuários, sendo as etapas primárias as altas ou óbitos. Resultados: a mortalidade foi semelhante entre o grupo tratado com aminoglicosídeo e o grupo tratado com polimixina B. Dentro do grupo aminoglicosídeo, a mortalidade foi maior no grupo que apresentava bactérias resistentes ao medicamento do que no grupo que apresentava infecção por organismo sensível a este medicamento. medicamento. A mortalidade não foi afetada por comorbidades, idade ou número de infecções hospitalares. O principal fator que levou à necessidade de diálise foi a combinação de dois medicamentos nefrotóxicos. Conclusão: surgiram duas hipóteses: a primeira seria que a substituição da polimixina B por aminoglicosídeos não impactou a mortalidade; a outra seria que, independentemente do grupo de antibióticos utilizado, os pacientes apresentavam alto risco de morte. Apesar das limitações amostrais, o estudo corrobora a adoção de estratégias para o uso racional de antimicrobianos.(AU)

Antecedentes y Objetivos: durante la pandemia de COVID-19, el número de pacientes críticos que requirieron cuidados intensivos aumentó considerablemente, resultando en un aumento de infecciones por microorganismos multirresistentes. En Brasil, en 2021, debido a la alta demanda del uso de polimixina B, hubo escasez nacional del medicamento. Una estrategia utilizada para superar esta situación fue el uso de aminoglucósidos. El trabajo tuvo como objetivo analizar el impacto de la sustitución de la polimixina B por amikacina y gentamicina en la etapa final de los pacientes. Método: estudio analítico con diseño observacional, transversal, con enfoque cuantitativo, mediante un análisis retrospectivo mediante el análisis de historias clínicas, siendo las etapas primarias las altas o defunciones. Resultados: la mortalidad fue similar entre el grupo tratado con aminoglucósido y el grupo tratado con polimixina B. Dentro del grupo de aminoglucósido, la mortalidad fue mayor en el grupo que tenía bacterias resistentes al fármaco que en el grupo que tenía infección con un organismo sensible a este. droga. La mortalidad no se vio afectada por las comorbilidades, la edad o el número de infecciones hospitalarias. El principal factor que llevó a la necesidad de diálisis fue la combinación de dos medicamentos nefrotóxicos. Conclusión: surgieron dos hipótesis: la primera sería que la sustitución de polimixina B por aminoglucósidos no impactó la mortalidad; la otra sería que, independientemente del grupo de antibióticos utilizado, los pacientes tenían un alto riesgo de muerte. A pesar de las limitaciones de la muestra, el estudio corrobora la adopción de estrategias para el uso racional de antimicrobianos.(AU)

Aminoglycoside resistance in domestic sewage and clinical Escherichia coli isolates

SUMMARY Introduction: Escherichia coli, a Gram-negative bacillus, is found in diverse environments and causes several human diseases, such as pneumonia and urinary tract infections. Aminoglycosides are antimicrobials that present high activity against Gram-negative species, including multidrug-resistant pathogens. However, the indiscriminate use of these compounds has selected resistant microorganisms, mainly due to the production of aminoglycoside-modifying enzymes (AME). Material and methods: The minimal inhibitory concentration of the aminoglycosides amikacin, gentamicin, and neomycin against clinical (CI, n = 52, only urinary) and domestic sewage (DS, n = 33) E. coli isolates was determined by the microdilution method, according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. The presence of AMEs among E. coli isolates was determined based on the susceptibility profile to amikacin, gentamicin, kanamycin, and tobramycin, according to Mancini et al. (2019). Results: Overall, 33.3% of the DS isolates and 100% of the CI isolates presented mechanisms of resistance to amikacin, gentamicin, or neomycin. The extended-spectrum beta-lactamase enzymes-producing isolates (23/27, 85%) showed mechanisms of resistance to gentamicin and/or neomycin and resistance to amikacin was simultaneously observed only in CI isolates. All DS isolates were considered wild-type-no AME, while APH (3') (14/52) and AAC (3') (10/52) enzymes were detected among CI isolates, one of which produces APH (3') and AAC (6')-I simultaneously. Conclusion: Resistance to aminoglycosides is present among E. coli isolates in Brazil, but to a lesser extent in environmental isolates. Besides, AMEs are frequent in CI isolates, and surveillance for antimicrobial resistance should be implemented to monitor aminoglycoside-resistant E. coli infections.

Introducción: Escherichia coli se encuentra en diversos ambientes y causa enfermedades humanas. Los aminoglucósidos son antimicrobianos que presentan actividad contra especies gramnegativas. Sin embargo, el uso indiscriminado de estos compuestos ha seleccionado microorganismos resistentes, principalmente debido a la producción de enzimas modificadoras de aminoglucósidos (AME). Material y métodos: La concentración mínima inhibitoria de aminoglucósidos frente a aislados de E.coli clínicos (CI, n = 52) y de aguas residuales sanitarias (DS, n = 33) se determinó mediante el método de microdilución, según la European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. La presencia de AME se determinó con base en el perfil de susceptibilidad a amikacina, gentamicina, kanamicina y tobra-micina, según Mancini et al. (2019). Resultados: 33,3% de los aislados de DS y 100% de los CI presentaron resistencia a amikacina, gentamicina o neomicina. Los aislados productores de enzimas betalactamasas de espectro extendido (23/27, 85%) mostraron resistencia a gentamicina y/o neomicina y la resistencia a amikacina se observó simultáneamente solo en CI. Todos los aislados de DS se consideraron wild type sin AME, mientras que las enzimas APH (3') (14/52) y AAC (3') (10/52) se detectaron entre CI, uno de los cuales produce APH (3') y AAC (6')-I simultáneamente. Conclusión: La resistencia a los aminoglucósidos está presente entre los aislados de E. coli en Brasil, pero en menor grado en los aislados ambientales. Se debe implementar la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos para monitorear las infecciones por E. coli resistentes a los aminoglucósidos.

SUMÁRIO Introdução: Escherichia coli é encontrada em vários ambientes e causa doenças em humanos. Os aminoglicosídeos são antimicrobianos que exibem atividade contra espécies Gram-negativas. No entanto, o uso indiscriminado desses compostos tem selecionado microrganismos resistentes, principalmente devido à produção de enzimas modificadoras de aminoglicosídeos (EMA). Material e métodos: A concentração inibitória mínima de aminoglicosídeos contra isolados de E. coli recuperadas de amostras clínicas (IC, n=52) e de águas residuais sanitárias (AR, n=33) foi determinada pelo método de microdiluição, de acordo com o European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. A presença de EMA foi determinada com base no perfil de suscetibilidade à amicacina, gentamicina, canamicina e tobramicina, de acordo com Mancini et al. (2019). Resultados: 33,3% dos ARS e 100% dos ICs apresentaram resistência à amicacina, gentamicina ou neomicina. Os isolados produtores de enzima beta-lactamase de espectro estendido (23/27, 85%) mostraram resistência à gentamicina e/ou neomicina e resistência à amicacina foi observada simultaneamente apenas em um IC. Todos os ARs foram considerados de tipo selvagem sem EMA, enquanto as enzimas APH (3') (14/52) e AAC (3') (10/52) foram detectadas entre os ICs, um dos quais produz APH (3') e AAC (6')-I simultaneamente. Conclusão: A resistência aos aminoglicosídeos está presente entre isolados clínicos de E. coli no Brasil, mas em menor grau em isolados ambientais. Assim a vigilância da resistência antimicrobiana deve ser implementada para monitorar infecções por E. coli resistentes aos aminoglicosídeos.

Resistencia enzimática en Pseudomonas aeruginosa, aspectos clínicos y de laboratorio / Enzymatic resistance in Pseudomonas aeruginosa, clinical and laboratory aspects

Resumen Pseudomonas aeruginosa es uno de los principales patógenos que causa infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS). Su capacidad de adaptación, diseminación, resistencia intrínseca a los antimicrobianos y de adquirir nuevos mecanismos a través de elementos genéticos móviles, hacen que el tratamiento de las infecciones por este microorganismo sea un desafío para el médico clínico. Intrínsecamente, P. aeruginosa, presenta una reducida permeabilidad en la membrana externa, debido a la expresión de bombas de expulsión, y una cefalosporinasa tipo AmpC inducible. Además, P. aeruginosa es capaz de adquirir nuevos determinantes de resistencia por transferencia horizontal en forma de casetes situados en integrones, y a su vez, localizados en transposones o plásmidos. Dentro de la resistencia enzimática que presenta P. aeruginosa destacan las β-lactamasas, incluyendo aquellas de espectro extendido (BLEE) y las carbapenemasas. Pero también enzimas modificadoras de los aminoglucósidos, haciendo que este microorganismo pueda presentar fenotipos de multi-resistencia (MDR), resistencia extrema (XDR) y panresistencia (PDR) a los antimicrobianos denominados antipseudomonas, incluyendo a las nuevas cefalosporinas con inhibidores de beta-lactamasas.

Abstract Pseudomonas aeruginosa is one of the major pathogens causing healthcare-associated infections (HAI). Its capacity of adaptation, dissemination, intrinsic resistance to antimicrobials and of acquiring new mechanisms through mobile genetic elements, make the treatment of infections by this microorganism a challenge for the clinician. Intrinsically, P. aeruginosa, presents a reduced permeability in the external membrane, due to the expression of efflux pumps, and an inducible AmpC-type cephalosporinase. In addition, P. aeruginosa is able to acquire new resistance determinants by horizontal transfer in the form of cassettes located in integrons, and in turn located in transposons or plasmids. Within the enzymatic resistance that P. aeruginosa presents, betalactamases, including extended spectrum (ESBL) and carbapenemases. But also aminoglycoside modifying enzymes, stand out, causing this microorganism to present multi-resistance phenotypes (MDR), extreme resistance (XDR) and pan-resistance (PDR) to the called antipseudomonal antibiotics, including the new cephalosporins with betalactamase inhibitors.

Antimicrobianos en neonatología. Parte I: Recomendaciones de dosificaciones basadas, en la más reciente evidencia en recién nacidos Comité Consultivo de Infecciones Neonatales, Sociedad Chilena de Infectología / Antibiotics in neonatology. Part I: Dosage recommendations based on the most recent evidence in newborns Advisory Committee on Neonatal Infections, Chilean Society of Infectious Diseases

Resumen Los antimicrobianos son los medicamentos más utilizados en los neonatos durante su primer mes de vida cuando se encuentran en unidades neonatales, principalmente por el alto riesgo que presentan de adquirir infecciones graves como la sepsis. La mayoría de estos antimicrobianos se utilizan con dosis extrapoladas en base a las recomendaciones en población adulta y niños mayores, a pesar de que la fisiopatología en los recién nacidos es absolutamente diferente. Lo anterior lleva a un mayor riesgo a que ocurran más efectos adversos los que pueden conducir a una mayor toxicidad y a fallas terapéuticas, entre otros. En la última década se han realizado mayores estudios farmacocinéticos de antimicrobianos en neonatos; esta reciente evidencia ha permitido nuevas recomendaciones de dosificación considerando el peso y la edad gestacional del recién nacido, entre otras variables, de acuerdo al antimicrobiano estudiado. En base a una mayor evidencia sobre el comportamiento farmacocinético de los antimicrobianos en neonatos, se ha elaborado este documento para así facilitar y promover su correcto uso en las unidades neonatales.

Abstract Antibiotics are the most widely used medications in neonates during their first month of life in neonatal units, mainly due to the high risk they present of acquiring serious infections such as sepsis. Most of these antibiotics are used with extrapolated doses based on the suggestions in the adult population and older children, despite the fact that the pathophysiology in newborns is absolutely different. This leads to a higher risk of more adverse effects occurring, which can lead to greater toxicity and therapeutic failures, among others. In the last decade more and more pharmacokinetic studies of antibiotics have been carried out in neonates, this recent evidence has led to new dosage recommendations taking into account the weight and gestational age of the newborn, among other variables, in agreement to the antibiotic studied. Therefore, based on the need to order and summarize the most up-to-date and most evidence-based information on antibiotics in neonates, this document was prepared to facilitate and promote its correct use in neonatal units.

Insuficiencia renal aguda en pacientes tratados con aminoglucósidos / Acute kidney injury in patients treated with aminoglycosides

Introducción: El riesgo de desarrollo de insuficiencia renal asociada al uso de aminoglucósidos es muchas veces una limitación para su uso en muchos profesionales de la salud. El objetivo de este trabajo fue conocer la frecuencia de insuficiencia renal en pacientes tratados con aminoglucósidos y los posibles factores asociados a su aparición. Materiales y métodos: Estudio descriptivo, longitudinal y prospectivo. Se incluyeron pacientes que recibieron aminoglucósidos por al menos 72 horas. Se realizó dosaje de creatinina basal y cada 48 horas durante el tratamiento antibiótico y luego de siete días de finalizado el mismo o posterior. Se definió insuficiencia renal aguda como el aumento de creatinina de 0,3 mg/dl con respecto a la basal. Resultados: Se analizaron datos de 107 pacientes y se halló una frecuencia de insuficiencia renal de 10,3%, siendo 5,8% durante el tratamiento aminoglucósido y 4,5% luego de la suspensión del mismo. Los pacientes que desarrollaron insuficiencia renal tenían mayores dosis de aminoglucósidos con respecto al grupo que no presentó dicho evento, siendo esta diferencia estadísticamente significativa. Conclusiones: La frecuencia de insuficiencia renal en pacientes tratados con aminoglucósidos resultó dentro de los intervalos descritos en la literatura y la mayoría de los pacientes presentaron recuperación completa de la función renal. Consideramos que la insuficiencia renal no supone un efecto adverso clínicamente significativo si los aminoglucósidos se usan con las precauciones adecuadas. Esto, sumado a sus buenos resultados clínicos y al bajo impacto en la ecología bacteriana, los convierte hoy en día en antibióticos de uso frecuente en nuestro hospital

The risk of developing renal failure associated with the use of aminoglycosides is often a limitation for its use in many health professionals. The objective of this study was to know the frequency of renal failure in patients treated with aminoglycosides and the possible factors associated with their appearance. Materials and methods: descriptive, longitudinal and prospective study. Patients who received aminoglycosides for at least 72 hours were included. Basal creatinine was measured and every 48 hours during the antibiotic treatment and after 7 days or more of its suspension. Acute renal failure was defined as an increase in creatinine of 0.3 mg/dl compared to baseline. Results: data from 107 patients were analyzed, and the frequency of renal failure was 10.3%, being 5.8% during the treatment with aminoglycoside and 4.5% after its suspension. The patients who developed renal failure had higher doses of aminoglycoside respect to the group that did not present this event, being this difference statistically significant. Conclusions: the frequency of renal failure in patients treated with aminoglycosides was within the ranges described in the literature and the majority of patients had complete recovery of renal function. We believe that renal failure does not represent a clinically significant adverse effect if aminoglycosides are used with adequate precautions. This, added to their good clinical results and low impact on bacterial ecology, makes them very used antibiotics today in our hospital

Factores asociados a coagulopatías adquiridas en una unidad de cuidados intensivos / Factors Associated with Acquired Coagulopathies in an Intensive Care Unit

Introducción: en los pacientes críticos existe un desequilibrio entre las actividades procoagulantes y las anticoagulantes, por ello las alteraciones de la coagulación o coagulopatías son una complicación frecuente que se asocia con una elevada morbilidad y mortalidad. Objetivos: identificar factores de riesgo asociados con coagulopatías adquiridas en pacientes ingresados y analizar la relación entre coagulopatía y mortalidad. Métodos: se realizó un estudio longitudinal prospectivo, donde se revisaron complementarios e historias clínicas de 29 pacientes ingresados en la unidad de cuidados intensivos del hospital Hermanos Ameijeiras, desde abril hasta junio de 2011. Se identificaron factores de riesgo asociados a las coagulopatías y se analizó su relación con la mortalidad. Resultados: se identificó la presencia de coagulopatías al ingreso en 58,62 por ciento, entre las 48-72 h 44,82 por ciento y en la última evaluación 51,73 por ciento. Predominó la coagulopatía por deficiencia de factores dependientes de vitamina K. Dentro de la unidad, el uso de hemocomponentes y la administración de aminoglucósidos resultaron estadísticamente significativos. Fallecieron 21 de los pacientes y en 13 de ellos se detectó la presencia de coagulopatía representando 44,8 por ciento. Conclusiones: se detectó que es dos veces más probable que a la persona que le administren hemocomponentes desarrolle algún tipo de coagulopatía y 5 veces más probable si se le administran aminoglucósidos. No se encontró relación significativa entre la presencia de coagulopatía y mortalidad, ni relación significativa entre la presencia de sangramiento y mortalidad(AU)

Introduction: There is an imbalance between procoagulant activities and anticoagulants in critical patients, so coagulation disorders or coagulopathies are a frequent complication associated with high morbidity and mortality. Objectives: To identify risk factors associated with acquired coagulopathies in hospitalized patients and to analyze the relationship between coagulopathy and mortality. Methods: A prospective longitudinal study was carried out. Complementary and clinical histories of 29 patients were reviewed. These patients had been admitted to the intensive care unit at Hermanos Ameijeiras hospital from April to June 2011. Risk factors associated with coagulopathies were identified. Mortality relationship was analyzed. Results: The presence of coagulopathies on admission was identified in 58.62 percent, 44.82 percent in 48-72 h and 51.73 percent in last assessment. Coagulopathy was predominant due to deficiency of vitamin K dependent factors. The use of blood components and the administration of aminoglycosides were statistically significant in the unit. Twenty one (21) patients died and thirteen (13) coagulopathy was detected, (44.8 percent). Conclusions: It was detected that it is twice as likely that the person receiving hemocomponents will develop some type of coagulopathy and five times more likely if they are administered aminoglycosides. No significant relationship was found between the presence of coagulopathy and mortality, nor significant relationship between the presence of bleeding and mortality(AU)

Impairing methylations at ribosome RNA, a point mutation-dependent strategy for aminoglycoside resistance: The rsmG case / Mutaciones en genes modificadores de ARN ribosómico y la resistencia a aminoglucósidos: el caso del gen rsmG

Introduction: Aminoglycosides like streptomycin are well-known for binding at specific regions of ribosome RNA and then acting as translation inhibitors. Nowadays, several pathogens have been detected to acquire an undefined strategy involving mutation at non structural ribosome genes like those acting as RNA methylases. rsmG is one of those genes which encodes an AdoMet-dependent methyltransferase responsible for the synthesis of m 7 G527 in the 530 loop of bacterial 16S rRNA. This loop is universally conserved, plays a key role in ribosomal accuracy, and is a target for streptomycin binding. Loss of the m 7 G527 modification confers low-level streptomycin resistance and may affect ribosomal functioning. Objectives: After taking into account genetic information indicating that some clinical isolates of human pathogens show streptomycin resistance associated with mutations at rsmG , we decided to explore new hot spots for mutation capable of impairing the RsmG in vivo function and of promoting low-level streptomycin resistance. Materials and methods: To gain insights into the molecular and genetic mechanism of acquiring this aminoglycoside resistance phenotype and the emergence of high-level streptomycin resistance in rsmG mutants, we mutated Escherichia coli rsmG and also performed a genotyping study on rpsL from several isolates showing the ability to grow at higher streptomycin concentrations than parental strains. Results: We found that the mutations at rpsL were preferentially present in these mutants, and we observed a clear synergy between rsmG and rpsL genes to induce streptomycin resistance. Conclusion: We contribute to understand a common mechanism that is probably transferable to other ribosome RNA methylase genes responsible for modifications at central sites for ribosome function.

Introducción. Los aminoglucósidos son moléculas antibióticas capaces de inhibir la síntesis de proteínas bacterianas tras su unión al ribosoma procariota. La resistencia a aminoglucósidos está clásicamente asociada a mutaciones en genes estructurales del ribosoma bacteriano; sin embargo, varios estudios recientes han demostrado, de forma recurrente, la presencia de un nuevo mecanismo dependiente de mutación que no involucra genes estructurales. El gen rsmG es uno de ellos y se caracteriza por codificar una metiltransferasa que sintetiza el nucleósido m 7 G527 localizado en el loop 530 del ribosoma bacteriano, este último caracterizado como sitio preferencial al cual se une la estreptomicina. Objetivo. Partiendo de las recientes asociaciones clínicas entre las mutaciones en el gen rsmG y la resistencia a estreptomicina, este estudio se propuso la caracterización de nuevos puntos calientes de mutación en este gen que puedan causar resistencia a estreptomicina usando Escherichia coli como modelo de estudio. Materiales y métodos. Se indagó sobre el mecanismo genético y molecular por el cual se adquiere la resistencia a estreptomicina y su transición a la resistencia a altas dosis mediante mutagénesis dirigida del gen rsmG y genotipificación del gen rpsL . Resultados. Se encontró que la mutación N39A en rsmG inactiva la proteína y se reportó un nuevo conjunto de mutaciones en rpsL que confieren resistencia a altas dosis de estreptomicina. Conclusiones. Aunque los mecanismos genéticos subyacentes permanecen sin esclarecer, se concluyó que dichos patrones secuenciales de mutación podrían tener lugar en otros genes modificadores del ARN bacteriano debido a la conservación evolutiva y al papel crítico que juegan tales modificaciones en la síntesis de proteínas.

Determinación del gen que codifica la enzima APH-(3´)-VIa en aislamientos de Acinetobacter 13TU:RUH1139 de origen hospitalario / Determination of the gene which codifies the APH-(3’)-VIa enzyme in Acinetobacter 13TU:RUH1139 isolates of nosocomial origin

El objetivo de este trabajo fue evaluar el fenotipo de resistencia y la presencia del gen aminoglucósido-O-fosfotransferasa-3´-VIa (aph-(3´)-VIa) en 23 aislamientos identificados como Acinetobacter 13TU:RUH 1139, provenientes de neonatos y soluciones parenterales, administradas a los mismos, en la Unidad de Alto Riesgo Neonatal (UARN) del Instituto Autónomo Hospital Universitario de Los Andes (IAHULA). Para la determinación de la susceptibilidad antimicrobiana se probaron seis aminoglucósidos mediante la prueba de difusión en agar (amikacina, gentamicina, tobramicina, netilmicina, dibekacina y neomicina), así como kanamicina y estreptomicina por dilución en agar. Todos los aislamientos resultaron resistentes a estreptomicina, más del 90% de los mismos mostraron resistencia ante amikacina, gentamicina y tobramicina, y el 82,6% fue resistente a netilmicina y dibekacina. Se detectó el gen aph-(3´)-VIa en 15 aislamientos de los neonatos y en 2 provenientes de las soluciones parenterales. Debido al elevado porcentaje de aislamientos resistentes a los aminoglucósidos, así como la presencia del gen aph-(3´)-VIa en Acinetobacter 13TU:RUH 1139, el uso de estos antimicrobianos como monoterapia debe ser restringido en el IAHULA y es necesario vigilar continuamente la diseminación genética de dicha resistencia.

The purpose of this work was to evaluate the resistance phenotype and the presence of aminoglucoside-0-phosphotransferase-3’-VIa (aph-(3’)-VIa) in 23 isolates identified as Acinetobacter 12TU:RUH 1139, obtained from neonates and parenteral solutions administered to them, at the Neonatal High Risk Unit (NHRU) of the Instituto Autónomo Hospital Universitario de Los Andes (IAHULA). Six aminoglucosides were examined for determination of antimicrobial susceptibility by the agar-diffusion test (amikacin, gentamycin, tobramycin, netilmycin, dibekacin, and neomycin), as well kanamycin and streptomycin by the agar-dilution test. All the isolates were streptomycin resistant, and over 90% of them showed resistance to amikacin, gentamycin, and tobramycin, and 82.6% was resistant to netilmycin and dibekacin. Gene aph-(3`)-VIa was detected in 15 isolates from neonates and in 2 from the parenteral solutions. Due to the high percentage of aminoglucoside-resistant isolates, as well as the presence of the gene aph-(3’)-VIa in Acinetobacter 13TU:RUH 1139, the use of these antimicrobials as monotherapy should be restricted at the AUHLA, and it is necessary to constantly survey the genetic dissemination of this resistance.

Detección de genes de virulencia en cepas de Enterococcus faecalis susceptibles y resistentes a aminoglucósidos / Detection of virulence genes in aminoglycoside susceptible and resistant Enterococcus faecalis

Background: Enterococcus spp. is an important cause of nosocomial infections A number of virulence factors that may enhance its ability to colonize have been described. Enterococcus is capable of acquiring resistance genes, including high-level resistance (HLR) to aminoglycoside antibiotics. Aim: to investigate the prevalence of genes encoding virulence factors in aminoglycosides susceptible and resistant E. faecalis. Materials and Methods: A total of 80 E. faecalis isolates from clinical (n: 52) and poultry samples (n: 28) were included in this study. Bacterial identification was performed by biochemical tests and phenotypificationwas done using the Phene-PlateTM system. Susceptibility to different antimicrobial agents was determined by the agar dilution method. Virulence genes aceI, agg, gelE and efaA were detected by multiplex PCR. Results: All isolates were susceptible to vancomycin and ampicillin. HLR to gentamicin (13.5%) and streptomycin (9.6%) was detected only in clinical isolates. The phenotyping revealed a great diversity of PhP-types, but only one clone with 7 strains of similar characteristics was found. The efaA gen was detected in 100% of the isolates. aceI gene was present in 94.2% and 75%, agg gene in 73.1%, and 67.9%, and gelE gene in 57.5% and 28.6% of the clinical and chicken isolates, respectively. Only 6 strains with HLR to aminoglycosides, belonging to the same phenotype, had the aceI, agg, gelE and efaA genes. Conclusions: E. faecalis with virulence genes and HLR to aminoglycosides were isolated from clinical and chicken samples in Antofagasta. More studies will be necessary to establish an association.

Antecedentes: Enterococcus spp. es una causa importante de infecciones nosocomiales, tanto en Chile como internacional. Se han descrito una serie de factores de virulencia en este microorganismo, que pueden, por ejemplo, aumentar su habilidad para colonizar. Enterococcus tiene capacidad de adquirir genes de resistencia, entre ellos la resistencia de alto nivel (RAN) a los antimicrobianos aminoglucósidos. Objetivo: Investigar la prevalencia de genes de virulencia en cepas de E. faecalis susceptibles y resistentes a aminoglucósidos. Material y Métodos: Un total de 80 cepas de E. faecalis aisladas de muestras clínicas (n: 52) y pollos (n: 28) se incluyeron en este estudio. La identificación se hizo por pruebas bioquímicas y se tipificaron por el sistema Phene-PlateMR. La susceptibilidad a diferentes antimicrobianos fue realizada por test de dilución en agar. Los genes de virulencia aceI, agg, gelE y efaA fueron investigados por RPC múltiple. Resultados: Todas las cepas de E. faecalis fueron susceptibles a vancomicina y ampicilina. Un 13,5% de las cepas clínicas presentaron resistencia de alto nivel a gentamicina y 9,6% a estreptomicina. La tipificación reveló una gran diversidad de fenotipos, pero se encontró un clon con 7 cepas de características similares. El gen efaA estaba presente en 100% de las cepas, gen aceI en 94,2 y 75%, gen agg 73,1 y 67,9% y gen gelE 57,5 y 28,6% de las cepas clínicas y de pollos, respectivamente. Seis cepas con resistencia de alto nivel a aminoglucósidos, que pertenecían a un mismo fenotipo exhibieron los genes efaA, aceI, agg y gelE juntos. Conclusiones: Cepas de E. faecalis que albergan genes de virulencia y con resistencia de alto nivel a aminoglucósidos fueron aisladas de muestras clínicas y de pollos en Antofagasta. Se requieren mayores estudios para establecer una asociación entre estos factores.

Infección urinaria adquirida en la comunidad en pacientes pediátricos: clínica, factores de riesgo, etiología, resistencia a los antibióticos y respuesta a la terapia empírica / Urinary tract infection acquired in the community in pediatric patients: Clinical picture, risk factors, etiology, antibiotic resistance, and response to empirical therapy

Objetivos. Describir la presentación clínica, factores de riesgo (FR), etiología y patrones de resistencia bacterianos en pacientes pediátricos hospitalizados con infección del tracto urinario (ITU) de la comunidad. Explorar factores de riesgo en ITU por bacterias resistentes. Evaluar respuesta clínica a la terapia empírica con aminoglucósidos y el protocolo institucional de antibióticos en ITU frente al perfil de sensibilidad de los aislamientos. Métodos. Estudio de corte trasversal entre febrero 2009-febrero 2011. Resultados: ingresaron 106 pacientes, 47 hombres (44,3%) vs. 59 mujeres (55,6%). El rango de edad más frecuente en ambos sexos fue 1-12 meses (63.2%). La ITU febril se presentó en el 78,7% de los hombres y en el 83,0% de las mujeres. Se encontraron FR en 59,4% de los pacientes y en el 27,3% se presentaron dos o más. Los principales agentes etiológicos fueron: Escherichia coli, Proteus mirabilis y Klebsiella pneumoniae; dos y 12 aislamientos (13.1%) expresaron β-lactamasas de espectro extendido (βLEE) o de tipo AmpC (presuntivo), respectivamente. En el análisis exploratorio, se observó una frecuencia significativamente superior del antecedente de malformación renal o de la vía urinaria en el grupo de pacientes con ITU causada por bacterias βLEE o AmpC (p=0,0095). La defervescencia como respuesta a la terapia empírica inicial con aminoglucósidos ocurrió en las primeras 36 horas en el 87,4% de los pacientes con ITU febril, independientemente del perfil de resistencia. Conclusiones. La ITU febril fue la principal presentación clínica. Se aislaron bacterias de la comunidad que expresaron βLEE+ o AmpC+. A nivel institucional el uso de aminoglucósidos son una buena alternativa para el tratamiento inicial debido a su alta efectividad clínica y bajo perfil de resistencia.

Objectives: to describe the clinical presentation, risk factors (RF), etiology and bacterial resistance patterns in pediatric patients hospitalized with urinary tract infection from the community. Explore risk factors related with UTI by resistant bacteria. To assess the clinical response to initial empirical therapy with aminoglycosides and the institutional protocol of antibiotics in UTI front to the sensitivity of the isolations. Material and methods: cross sectional study from february/2009 to february/2011. Results: 106 patients were registered, 47 men (44,3%) vs. 59 women (55,6%). The most frequent age in both sexes was 1-12 months (63,2%). The febrile UTI was present in 78,7% of the men vs. 83,0% of the women. RF were found in 59,4% of the patients and 27,3% showed two or more. The main aetiological agents were: Escherichia coli, Proteus mirabilis, and Klebsiella pneumoniae; two and 12 isolations showed expression of extended spectrum beta-lactamases (EEβL) and β-lactamases AmpC type (presumptive), respectively. The exploratory analysis found a significantly higher frequency of antecedent of anatomic abnormalities of the kidney or urinary tract in the group of patients with UTI caused by EE β L o AmpC bacteria (p=0.0095). The last fever peak, as answer to the initial empirical therapy with aminoglycosides, occurred in the first 36 hours in the majority of the patients (87,4%) with febrile UTI, independent of resistance profile. Conclusions: Febrile ITU was the main clinical presentation. EEβL+ or AmpC+ bacteria were isolated from the community. At an institutional level the use of aminoglycosides are a good alternative for the initial treatment due to their high clinical effectiveness and low resistance profile.

Infección urinaria de la comunidad en pacientes pediátricos de la Clínica Universitaria Bolivariana: etiología, presentación clínica, factores de riesgo y respuesta clínica a la terapia empírica inicial / Urinay tract infection from the community in pediatric patiens of the clinica Universitari Bolivariana: etimology, clinical presentation, risk factors and clinical response to initial empirical therapy

Objetivo: describir las características clínicas, reconocer los posibles factores de riesgo (FR) para ITU, el perfil de sensibilidad antibiótica, evaluar el protocolo institucional y la respuesta clínica a la terapia empírica inicial.Metodología: estudio transversal prospectivo realizado entre febrero/2009-enero/2010. Resultados: ingresaron 47 pacientes, 25 hombres (53.2%) vs. 22 mujeres (46.8%). El rango de edad más frecuente para ITUen ambos sexos fue 1-24 meses (76.5%), es decir, hay un claro predominio en el género masculino (58.3%). Se encontraron FR en 51.1% de los pacientes y en 21.2% se presentaron dos o más FR. Los principales fueron: ITU previa (19.1%),malformaciones de la vía urinaria (17%), estreñimiento (12.7%), mala higiene (12.7%), reflujo vesico-ureteral (6.4%). Los principales agentes etiológicos fueron: Escherichia coli (31), Proteus mirabilis (5), Klebsiella pneumoniae (3) y Citrobacter freudii (2); 2 y 5 aislamientos presentaron beta lactamasas de espectro extendido (#LEE) y #-lactamasas tipo AmpC, respectivamente. La defervescencia como respuesta a la terapia empírica inicial con aminoglucósidos ocurrió en las primeras 36 horas en lamayoría de los pacientes (87%) con ITU febril, independiente del perfil de resistencia. Conclusiones: la ITU febril fue la principal presentación clínica con un alto porcentaje de FR identificados solo por interrogatorio y examen físico dirigido. Se aislaron bacterias de la comunidad que fueron #LEE+ o AmpC+. Desde el punto de vista institucionalel uso de aminoglucósidos son una buena alternativa para el tratamiento inicial debido a su alta efectividad clínica y bajo perfil de resistencia.

Objective: to describe the clinical characteristics, identify possible risk factors (RF) for UTI, describe antibiotic sensitivity profiles, evaluate the institutional empirical antibiotic protocol and the clinical response to initial empirical therapy. Methods: cross-sectional observational study from february/2009 to january /2010. Results: 47 patients were admitted, 25 males (53,2%) and 22 females (46,8%). The most frequent age group in both sexes was 1-24 months (76,5%), predominating in the male gender (58,3%). RF were found in 51,1% of the patients and 21,2%showed two or more RF. The main ones being: previous UTI (19.1%), urinary tract malformations (17%), constipation (12,7%), bad higiene (12.7%), vesicoureteral reflux (6,4%). The main aetiological agents isolated were: Escherichia coli (31), Proteusmirabilis (5), Klebsiella pneumoniae (3) and Citrobacter freudii (2); 2 and 5 isolates had extended spectrum beta-lactamases (#LEE) and AMP C #-lactamases, respectively. Resolution of fever occurred in the first 36 hours in the majority of the patients (87%), independent of resistance profile of the isolates. This being a reliable parameter of clinical response to empirical anitbiotic therapy with aminoglycosides. Conclusions: febrile UTI was the main clinical presentation with a high percentage of RF identified only by history and physical examination. #LEE+ or AmpC+ bacteria were isolated from the community. At an institutional level the use of aminoglycosides are a good alternative for the initial treatment due to the good clinical response and low level of resistance.

Resistencia a linezolid en Staphylococcus aureus resistente a meticilina y enterococos con elevada resistencia a aminoglucósidos en un hospital pediátrico de tercer nivel / Resistance to linezolid in methicillin-resistant Staphylococcus aureus and Enterococcus with high-level resistance to aminoglycosides in a third-level pediatric hospital

Introducción: El surgimiento de resistencia a oxazolidinonas en Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (SAMR) y Enterococcus spp con elevada resistencia a aminoglucósidos (EERA), aún cuando no han sido expuestos al antibiótico, es una de las principales razones para el control en el uso clínico de estos antibióticos. Métodos: Se estudiaron 95 cepas de SAMR y EERA, las cuales fueron aisladas de enero 2003 a diciembre 2007 en el Hospital Infantil de México Federico Gómez; se identificaron por pruebas convencionales. Se evaluó la susceptibilidad a diversos antimicrobianos incluyendo linezolid de acuerdo al Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio (CLSI). Se comprobó la elevada resistencia a aminoglucósidos al amplificar los genes aac(6')-le, aph(2")-la y ant(6') en enterococos y el tipo de cásete cromosomal estafilocócico mee (SCCmec) asociado a la resistencia a meticilina en S. aureus, por técnicas moleculares previamente descritas. Resultados: Todas las cepas de SAMR mostraron el SCCmec tipo II. El 100% de los enterococos con fenotipo EERA mostraron genes asociados con los niveles elevados de resistencia a aminoglucósidos. El 12% (6/50) de EERA presentó valores intermedios a linezolid (concentración inhibitoria mínima (CIM) de 4 μg/mL) y sólo una cepa fue resistente (CIM 128 μg/mL); un aislamiento fue resistente a vancomicina fenotipo y genotipo van A, pero sensible a linezolid. El 2.2% (1/45) de los SAMR fue resistente a linezolid (CIM 8 μg/mL). Conclusión: Linezolid es una opción terapéutica de gran valor clínico. Sin embargo, son necesarios monitoreos continuos para conocer el riesgo de surgimiento de cepas resistentes y establecer lineamientos en el uso apropiado del antibiótico.

Background: The emergence of resistance to the oxazolidinones by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and high-level aminoglycoside-resistant (HLRA) Enterococcus spp not exposed is one of the main reasons for control of the clinical use of these antibiotics. Methods: We studied 95 strains of MRSA and HLAR, which were isolated from January 2003 to December 2007 at the Hospital Infantil de México Federico Gómez. The strains were identified by conventional tests. Antimicrobial susceptibility was evaluated for several antimicrobial agents including linezolid according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). The high resistance to aminoglycosides was tested by amplification of genes aac (6')-/e, aph (2")-and ant (6') in enterococci. Staphylococcal cassette chromosomal mec (SCCmec) associated with MRSA was identified by molecular techniques described previously. Results: All MRSA strains showed SCCmec type II, and 100% of enterococci strains with phenotype HLAR showed genes associated with high-level aminoglycoside resistance; 12% of HLAR enterococci strains showed intermediate values to linezolid (MIC 4 μg/mL) and only one strain was resistant (MIC 128 μg/mL). Of the MRSA strains, 2.2% were resistant to linezolid (MIC 8 μg/mL). Conclusion: Linezolid is a clinically valuable option as a form of therapy. However, continuous surveillance is necessary to determine the emergent risk of resistance strains and to establish guidelines for appropriate use.

Aislamiento de Staphylococcus epidermidis portador de integrón clase 1en un paciente con sepsis neonatal / Isolation of Staphylococcus epidermidis strain carrier of the class one integron in a septic neonatal patient

Objetivo. Determinar la presencia y secuencia del integrón clase I en un aislamiento clínico de Staphylococcus epidermidis proveniente de un neonato con diagnóstico de sepsis. Materiales y métodos. En una cepa de S. epidermidis, aislada de una muestra de hemocultivo de un neonato, se realizaron las pruebas de identificación microbiológica, susceptibilidad antimicrobiana y la caracterización molecular de los genes aac6'-aph2'', mecA, el gen de la integrasa intI1 y el gen casete aac6'. Resultados. Se identificó el gen de la integrasa intl1 y mediante secuenciación de nucleótidos se encontró una homología del 78% con las secuencias reportadas en la base de datos del NCBI para bacterias Gram negativas. También se evidenció el casete genético aac6' presente dentro del integrón clase 1, el cual acetila los aminoglucósidos para conferir resistencia a este antibiótico; como parte de la caracterización molecular se encontró la presencia del gen (aac6'-aph2''), que codifica para una enzima bifuncional que inactiva a los aminoglucósidos, y el gen mecA que confiere resistencia a los ß-lactámicos. En las pruebas de susceptibilidad se encontró resistencia a ampicilina, oxacilina y gentamicina. Conclusiones. Se reporta por primera vez en Colombia, la secuencia del gen de la integrasa intl1 en un aislamiento de S. epidermidis, proveniente de un recién nacido con sepsis neonatal de la unidad de cuidados intensivos en un hospital de tercer nivel de Bogotá. Esta integrasa ha sido relacionada sólo en integrones clase 1, los cuales se han asociado a multirresistencia en aislamientos clínicos en bacterias Gram negativas. El hallazgo de este mecanismo de resistencia, en el presente estudio realizado en una bacteria Gram positiva, sugiere la relación con transferencia horizontal de genes de resistencia entre especies, efectuado mediante la...

Objective: To determine the presence and the sequence of the class one integron in a Staphylococcus epidermidis strain isolated from a septic neonatal patient. Materials and methods: The S. epidermidis strain was isolated from a blood culture of a newborn. The microbiological identification, test of sensitivity and molecular characterization of the integrase gene int/1, the cassette gene aac6; aac6'aph2'' resistant gene to aminoglycoside antibiotics and mecA gene resistant to ß-lactamics were realized. Results: The nucleotide sequence of the integrase gen intl1 in S. epidermidis is reported, which showed a 78% similarity to the reported sequence of the NCBI data base in Gram negative bacteria. The gene cassette aac6 aac6' (aminoglycoside acetilation) was also identified within the class one integron confering aminoglycoside resistance. Through molecular characterization we also found the aminoglycoside ß-lactamics resistance genes (aac6'aph2'y mecA'); the susceptibility tests showed resistance to ampicilin, oxacilin and gentamicin. Conclusions: The nucleotide sequence of the integrase gen int/1 is reported for the first time in Colombia in a S. epidermidis strain isolated from a septic neonatal patient, at the neonatal care unit of a third level hospital in Bogotá. This integrase in class one integron was reported, which has shown multiresistance association in clinical isolates in Gram negative bacteria. The resistance mechanism found during this approach realized in Gram negative bacteria showed the evidence of an interspecies horizontal transfer especially by gene transfer or by moving elements such as integrons and gene cassettes.The molecular character of the causing agent of sepsis is important for epidemiological control of the infection and treatment in the newborn.